Sekretaris Perusahaan (corporate secretary) adalah organ pendukung bagi Dreksi dalam menjalankan fungsi pengurusan perseroan. Sekretaris Perusahaan adalah orang perseorangan atau penanggung jawab dari unit kerja yang menjalankan fungsi sekretaris perusahaan. Sekretaris Perusahaan berfungsi sebagai penghubung (liaison officer) antara perusahaan dengan otoritas dan pihak-pihak lain di luar perusahaan termasuk bertugas membantu Direksi dalam penerapan Tata Kelola Perusahaan Yang Baik (GCG) seperti keterbukaan informasi perusahaan kepada seluruh pemangku kepentingan.
Pertamina EP tidak lagi memiliki Sekretaris Perusahaan sejak reorganisasi per 1 April 2021. Namun demikian Perseroan menunjuk Sr. Manajer Relations setiap Regional untuk menjalankan fungsi ini. Sekretaris Perusahaan memiliki memiliki peran penting sebagai penghubung antara Pemegang Saham, Dewan Komisaris, Direksi serta pemangku kepentingan. Sekretaris Perusahaan juga bertindak sebagai koordinator atas kepatuhan di bidang hukum dan mengadminstrasikan dokumen penting Perusahaan, serta senantiasa meningkatkan hubungan komunikasi internal dan eksternal terkait dengan kegiatan usaha PT Pertamina EP.